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イオンクロマトグラフィー（Ion Chromatography、IC) またはイオン交換クロマトグラフィー (Ion-exchange chromatography）は、イオンや極性分子のような電荷をもつ分子を分離するクロマトグラフィーである。大きなタンパク質、小さな核酸、そしてアミノ酸などを含むほとんどの電荷分子でこの方法を使うことができ、タンパク質の洗浄、水の分析、品質の調整などに使われている。
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