小型キャピラリー電気泳動シーケンサー DS3000

DS3000の主な仕様 小型キャピラリー電気泳動シーケンサー ■ 本体仕様 DS3000 項目　　　　　　　　　　　　　　　　　　　内容 キャピラリー数 4 本 キャピラリー長 36 cm サンプルトレイ 8連チューブ×4 装置制御 タッチパネルPC 同時検出 6 色 アプリケーション シーケンシング解析/フラグメント解析 サイズ 400（ W）×600（ D）×600（ H） mm 重量 45 kg 性能保証温度 15 – 30 ℃ 性能保証湿度 20 – 80％ RH（結露しないこと） DS3000 電源 100 – 240 ±10％ VAC、50/60 Hz 定格電力 260 Compact CE Sequencer VA 対応二次解析ソフトウェア ・Mutation Surveyor（ SoftGenetics社製 別売り） ・GeneMarker（ SoftGenetics社製 別売り） ・GeneMarker HID（ SoftGenetics社製 別売り） ■ランモジュール仕様 読取塩基長※1 平均ランタイム ランモジュール　　　　　　　　　　アプリケーション　　　ポリマータイプ （QV20 CRL） （分） Fast_Sequence36_Polymer7 シーケンシング解析 Polymer7 600 40 Standard_Sequence36_Polymer7 シーケンシング解析 Polymer7 700 70 BDx_Fast_Sequence36_Polymer7 BDx シーケンシング解析※2 Polymer7 600 40 BDx_Standard_Sequence36_Polymer7 BDx シーケンシング解析※2 Polymer7 700 70 ランモジュール　　　　　　　　　　アプリケーション　　　ポリマータイプ 平均ランタイム サイジング精度 （分） （50 – 400 bp） Fragment_Analysis36_Polymer7　　 フラグメント解析 Polymer7 38 < 0.16※3 　　 Fragment_Analysis36_Polymer4　　 フラグメント解析 Polymer4 44 < 0.16※4 ■消耗品仕様 品名 　　　　　 　　 　 パーツ ナ　ン　バー　　　　 内容　　　　　　　 使用上限回数　　　 備考 Capillary Cartridge 36 cm 613-0330 1個 300インジェクション/個 保管温度：15 – 30 ℃ Buffer 613-0252 Anode Buffer Cartridge×2個 80インジェクション/個 保管温度： 2 – 10 ℃ Cathode Buffer Cartridge×2個 Polymer7 613-0292 Cartridge×4個 24インジェクション/個 保管温度： 2 – 10 ℃ Polymer4 613-0290 Cartridge×4個 24インジェクション/個 保管温度： 2 – 10 ℃ Septa for Cathode Buffer Cartridge 613-7231 10個 都度交換 Retainer for Cathode Buffer Cartridge 613-7233 4個 - Septa for 8 well tubes 613-7230 24個 都度交換 Base and Retainer for 8 well tubes 613-7232 4個 - Anode Electrode Assembly 613-7263 1個 - ※１．読取塩基長（QV20 CRL）はApplied Biosystems™ BigDye™ Terminator v3.1 Sequencing Standard Kit（ サーモフィッシャーサイエンティフィック社製：別売り）を用いて検証されています。 ※２．BDxシーケンシング解析はサーモフィッシャーサイエンティフィック社のApplied Biosystems™ BigDye XTerminator™ Purification Kitを用いて精製したサンプルの解析モジュールです。 ※３.Polymer7のサイジング精度（50 – 400 bp）はGenePrint ® 24 System Allelic Ladder MixとWEN ILS 500（Promega社製：別売り）を用いて検証されています。 ※4.Polymer4のサイジング精度（50 – 400 bp）はPowerPlex™ ESI17 Fast Allelic Ladder MixとWEN ILS 500 ESS（Promega社製：別売り）を用いて検証されています。 ・本カタログに記載のデータは測定例を示すもので、数値の保証をするものではありません。 ・本カタログの画面は、はめ込みです。 ・本製品は研究用であり、薬機法に基づく医療機器として承認・認証等を受けた機器ではありません。診断目的およびその手続き上での使用はできません。 ・本カタログ中の会社名、商品名は各社の商標および登録商標です。 ・Applied Biosystems™、BigDye™、BigDye XTerminator™はサーモフィッシャーサイエンティフィックの商標です。 ・Promega®はPromega Corporationの登録商標であり、PowerPlex™はPromega Corporationの商標です。 安全に関するご注意 本社 〒105-6409 東京都港区虎ノ門一丁目１７番１号 虎ノ門ヒルズ ビジネスタワー ●ご使用の前に「取扱説明書」をよくお読みのうえ正しくご使用ください。 TEL（: 03）3504-5768 E-mail :hhtgene.aj@hitachi-hightech.com www.hitachi-hightech.com/jp/ja/lm/ お問い合わせは̶̶ 3504-7211 本社 〒104-0041 東京都中央区新富二丁目15番5号 RBM築地ビル TEL:(0120)-513-522 www.hitachi-hightech.com/han/ ●このカタログに掲載した製品は、改善のため外観または仕様の一部を予告なく変更することがあります。 ●Copyright(C)　Hitachi High-Tech Corporation 2025 All rights reserved. HTB-281V 2025.6

手軽に使えて小型で便利な 直観的で使いやすいタッチパネルスクリーン DNAシーケンサー Simple タッチパネル式GUIを搭載し、省スペース化と操作性の向上を実現しました。 ひと目で状況を確認でき、測定までのプロセスをシンプルにしたことで、 手軽に遺伝子解析を行うことができます。 DS3000は、“コンパクト”でありながらも当社が長年培ったコア技術である キャピラリー技術とレーザー照射技術が受け継がれています。 シーケンシング解析とフラグメント解析を手軽に行うことが出来ます。 使いやすさと操作性を第 一に考えたフラットデザイ ンなタッチパネルスクリー ンとなっています。メイン メイン画面 画面は測定、結果確認、メ Simple Smart Usability ンテナンス、プロトコルの4 つから構成されており、ワ ンタッチで詳細画面を表 示することができます。 直観的で使いやすい 装置内に設置しやすい 設置スペースを節約する タッチパネルスクリーン カートリッジ方式 コンパクトなデザイン メンテナンス頻度の低減 ユーザーの利便性向上 ●ポンプ洗浄不要 ●遠隔モニタリングシステム搭載 ●気泡除去不要 ●お持ちの汎用PC活用による ●光源交換頻度低減 　導入コスト低減 消耗品管理画面 カートリッジ設置ガイド画面 インストールされた消耗品の情報、装置上での保管期限など 設置方法、手順をひと目で把握できるように表示しているた が表示されます。装置に記憶されたインジェクション数をもと め、初めて装置を使用するユーザーにも、不定期にご使用の に消耗品の残りの使用回数を自動で計算するので、消耗品管 ユーザーにも安心してご使用いただけます。 理の手間を軽減することが出来ます。 キャリブレーション画面 測定結果画面 DS3000 泳動前のポリマー充填とキャリブレーションを行うことが 測定した項目の結果を一画面で確認出来ます。また、各値 できます。各キャピラリーの信号強度を波形および数値に を用いてPass/Failの判定を自動で行い、ひと目で測定結 Compact CE Sequencer て表示し、Pass/Fail判定を自動で行い、ひと目で結果を 果を確認することが出来ます。 確認することができます。 1 DS3000 Compact CE Sequencer Compact CE Sequencer DS3000 2

装置内に設置しやすいカートリッジ方式 設置スペースを節約するコンパクトなデザイン Smart 装置内部に設置する消耗品はどなたでも容易に設置可能なカートリッジ方式を Usability DS3000はタッチパネル式GUIを搭載することにより、設置面積を大幅に削減しました。 採用しています。また、送液機構のポンプレス化と新たにレーザーダイオード光源（LD光源）を 幅400×奥行600×高さ600 mmというコンパクト省スペースを実現しています。 搭載することで、メンテナンス頻度が低減するとともに操作性が向上しました。 DS3000のカートリッジの特長 W 400 mm ●4本キャピラリー　●8連チューブ　●汚染や異物侵入の防止　 ●各試薬、キャピラリーカートリッジのインジェクション数をトラッキング機能で管理　 ●Polymer7、Polymer4　●簡単な脱着 キャピラリー カートリッジ 装置内部 アノードバッファー カートリッジ カソードバッファーカートリッジ ポリマーカートリッジ ユーザーの利便性向上 ●遠隔モニタリングシステム搭載 ●お持ちの汎用PC活用による導入コスト低減 サンプルカートリッジ 遠隔モニタリングシステムを搭載することにより、Webブラウザ上から装置状 ユーザーが利用しているネットワークに接続することができ、汎用PCに 況のモニタリング、アッセイ条件の設定、解析結果の表示ならびに、レポート生 よるレポート出力や二次解析ソフトウェアなどを流用することができ、 成などを行うことが可能になります。「離れた場所からの装置へのアクセス」を 導入コストを低減することができます。 可能にすることよって利便性の向上、効率的なワークフローを実現します。 メンテナンス頻度の低減 Web Server ・ タッチパネルGUI ●ポンプ洗浄不要 ●気泡除去不要 ●光源交換頻度低減 ・ 電気泳動制御 ースコール/サイズコール（1次解析） ・ Webブラウザ 顧客準備汎用PC ・ ベ 耐久性の高いシール可動式のシリンジ式ポリマー 独自のポリマーインジェクション LD光源のアナログパルス信号制御によ ・ ・ シーケンシング解析ソフト（二次解析） （Webブラウザ） Web/SQLサーバー ・ セキュリティソフト ・ フラグメント解析ソフト（二次解析） カートリッジを開発し、送液機構をポンプレス化する 方式を採用することで、ポリマー り、測定時のみ点灯するため、実点灯時間 ことで、ポンプのメンテナンスが不要になりました。 充填時の気泡除去が不要とな が短く、煩雑で高価な光源（Arガスレー また新システムの搭載により、ポリマーの種類を変 り、無駄なポリマー消費を低減さ ザー光源）と比較して、長寿命化を可能に 更する時の時間短縮・コスト削減を実現しました。 せました。 しています。 CCE装置本体 （オールインワン設計） 顧客準備汎用PC （Webブラウザ） レポート出力 DS3000 Compact CE Sequencer Router （Firewall） ポリマータイプ変更時のワークフロー ※他社製品との比較 分析条件アップロード 既存手法 洗浄液 ポリマー ポリマー setup 洗浄工程 setup 充填 気泡除去 ユーザー先ネットワーク 一次解析結果表示/ダウンロード 装置稼動状態 新ポリマー DS3000 カートリッジ 新ポリマー setup 充填 約5分程度 大幅な時間短縮 約1時間程度 日立ハイテク出荷製品 ユーザー先設備 3 DS3000 Compact CE Sequencer Compact CE Sequencer DS3000 4 H 600 mm

シーケンシング解析 フラグメント解析 ■読取塩基長 ■マイクロサテライト不安定性解析 装置の分離能を示す一例として、既知のマイ 腫瘍組織由来 クロサテライト不安定性（MSI）を含む市販 正常組織由来 のFFPE組織切片から全自動核酸抽出装置 （magLEAD 12gC）を用いてDNAを精製 し、Promega社のMSI Analysis System, MONO-27 Version 1.2を用いてフラグメント解析を行 塩基長 いました。二次解析ソフト（GeneMarker）に て比較解析を行ったところ、異なる反復回数 QVスケール のシグナルが検出されました。 ※１．本製品は研究用であり、薬機法に基づく医療機器として承認・認証等を受けた機器ではありません。診断目的およびその手続き上での使用はできません。 ※２．市販サンプルを用いて本データを取得いたしました。 ※３. 全自動核酸抽出装置にはmagLEAD 12gC（プレシジョン・システム・サイエンス社製：別売り）を用いています。 ※４．波形画面はGeneMarke（r SoftGenetics社製：別売り)を用いて表示したものです。 ■ショートタンデムリピート解析 GUI画面 波形データ（例 Standard Sequencing) Standard SequencingモードでBigDye™ Terminator v3.1 Sequencing Standard Kitを用いてシーケンシング解析を行いました。 Promega社の2800 MコントロールDNA DS3000では、性能保証温度（15 – 30 ℃）内において、読取塩基長600 bp以上（Fast Sequencing）もしくは700 bp以上（Standard とPowerPlex™ Fusion 6C Systemで増 Sequencing）を保証しています。 幅し、6 dye対応の泳動モジュールで解析を 行いました。 その後、二次解析ソフト（GeneMarker HID）でデータを読み込み、遺伝子型を描 画しました。 ■変異解析 ※１．本製品は研究用であり、薬機法に基づく医療機器と 　　して承認・認証等を受けた機器ではありません。診 　　断目的およびその手続き上での使用はできません。 ※２．市販サンプルを用いて本データを取得いたしま 　　した。 ※３．波形画面はGeneMarker HID（SoftGenetics 　　社製：別売り)を用いて表示したものです。 野生型 Custom Dye（ DS3000に設定されている既存Dye Set以外を検討するFragment解析ユーザー向け） ■Dye Setの新規作成機能 Custom Dyeを使用することにより、任意のMatrix, Sample DyesのDyeを一からカスタム可能となります。またサンプル測定に使用しない Dyeを設定できます。下記のようにDye Setをカスタムすることができ、サンプル測定に使用できます。 混合DNA 項目ラベル　　　　　　　 値 Spectral Calibrationで Mutation（塩基座標） 173338 使用するDyeを設定できますT>TG Mutation（アミノ酸座標） 858L>L/R Spectral Calibrationで 各Dyeが検出される順番に Intensity 1313 応じて設定できます サンプル測定で使用しない 既知の変異を含むゲノムDNA（混合DNA）を市販の細胞株より精製しシーケン Dropping Factor: 変異割合 0.58 Dyeを設定できます シング解析を行いました。その後、二次解析ソフト（Mutation Surveyor）にて S/N Ratio 3.72 解析を行ったところ、目的の変異が検出されました。 Mutation Score 36.66 ※DS3000に設定されているFragment解析用Matrix Standard（ 既存Dye Set）一覧 ※１．本製品は研究用であり、薬機法に基づく医療機器として承認・認証等を受けた機器ではありません。 Annotation dbSNP:121434568 　　 診断目的およびその手続き上での使用はできません。 PowerPlexTM 4C Matrix Standard DS-30 Matrix Standard Kit (Dye Set D) DS-33 Matrix Standard Kit (Dye Set G5) Matrix Standard BT5 ※２．市販サンプルを用いて本データを取得いたしました。 PowerPlexTM 5C Matrix Standard DS-31 Matrix Standard Kit (Dye Set D) DS-36 Matrix Standard (Dye Set J6) Matrix Standard BT6 ※３．波形画面はMutation Surveyor（SoftGenetics社製：別売り）を用いて表示したものです。 PowerPlexTM 6C Matrix Standard DS-32 Matrix Standard Kit (Dye Set F) 5 DS3000 Compact CE Sequencer Compact CE Sequencer DS3000 6

DS3000の主な仕様 小型キャピラリー電気泳動シーケンサー ■ 本体仕様 DS3000 項目　　　　　　　　　　　　　　　　　　　内容 キャピラリー数 4 本 キャピラリー長 36 cm サンプルトレイ 8連チューブ×4 装置制御 タッチパネルPC 同時検出 6 色 アプリケーション シーケンシング解析/フラグメント解析 サイズ 400（ W）×600（ D）×600（ H） mm 重量 45 kg 性能保証温度 15 – 30 ℃ 性能保証湿度 20 – 80％ RH（結露しないこと） DS3000 電源 100 – 240 ±10％ VAC、50/60 Hz 定格電力 260 Compact CE Sequencer VA 対応二次解析ソフトウェア ・Mutation Surveyor（ SoftGenetics社製 別売り） ・GeneMarker（ SoftGenetics社製 別売り） ・GeneMarker HID（ SoftGenetics社製 別売り） ■ランモジュール仕様 読取塩基長※1 平均ランタイム ランモジュール　　　　　　　　　　アプリケーション　　　ポリマータイプ （QV20 CRL） （分） Fast_Sequence36_Polymer7 シーケンシング解析 Polymer7 600 40 Standard_Sequence36_Polymer7 シーケンシング解析 Polymer7 700 70 BDx_Fast_Sequence36_Polymer7 BDx シーケンシング解析※2 Polymer7 600 40 BDx_Standard_Sequence36_Polymer7 BDx シーケンシング解析※2 Polymer7 700 70 ランモジュール　　　　　　　　　　アプリケーション　　　ポリマータイプ 平均ランタイム サイジング精度 （分） （50 – 400 bp） Fragment_Analysis36_Polymer7　　 フラグメント解析 Polymer7 38 < 0.16※3 　　 Fragment_Analysis36_Polymer4　　 フラグメント解析 Polymer4 44 < 0.16※4 ■消耗品仕様 品名 　　　　　 　　 　 パーツ ナ　ン　バー　　　　 内容　　　　　　　 使用上限回数　　　 備考 Capillary Cartridge 36 cm 613-0330 1個 300インジェクション/個 保管温度：15 – 30 ℃ Buffer 613-0252 Anode Buffer Cartridge×2個 80インジェクション/個 保管温度： 2 – 10 ℃ Cathode Buffer Cartridge×2個 Polymer7 613-0292 Cartridge×4個 24インジェクション/個 保管温度： 2 – 10 ℃ Polymer4 613-0290 Cartridge×4個 24インジェクション/個 保管温度： 2 – 10 ℃ Septa for Cathode Buffer Cartridge 613-7231 10個 都度交換 Retainer for Cathode Buffer Cartridge 613-7233 4個 - Septa for 8 well tubes 613-7230 24個 都度交換 Base and Retainer for 8 well tubes 613-7232 4個 - Anode Electrode Assembly 613-7263 1個 - ※１．読取塩基長（QV20 CRL）はApplied Biosystems™ BigDye™ Terminator v3.1 Sequencing Standard Kit（ サーモフィッシャーサイエンティフィック社製：別売り）を用いて検証されています。 ※２．BDxシーケンシング解析はサーモフィッシャーサイエンティフィック社のApplied Biosystems™ BigDye XTerminator™ Purification Kitを用いて精製したサンプルの解析モジュールです。 ※３.Polymer7のサイジング精度（50 – 400 bp）はGenePrint ® 24 System Allelic Ladder MixとWEN ILS 500（Promega社製：別売り）を用いて検証されています。 ※4.Polymer4のサイジング精度（50 – 400 bp）はPowerPlex™ ESI17 Fast Allelic Ladder MixとWEN ILS 500 ESS（Promega社製：別売り）を用いて検証されています。 ・本カタログに記載のデータは測定例を示すもので、数値の保証をするものではありません。 ・本カタログの画面は、はめ込みです。 ・本製品は研究用であり、薬機法に基づく医療機器として承認・認証等を受けた機器ではありません。診断目的およびその手続き上での使用はできません。 ・本カタログ中の会社名、商品名は各社の商標および登録商標です。 ・Applied Biosystems™、BigDye™、BigDye XTerminator™はサーモフィッシャーサイエンティフィックの商標です。 ・Promega®はPromega Corporationの登録商標であり、PowerPlex™はPromega Corporationの商標です。 安全に関するご注意 本社 〒105-6409 東京都港区虎ノ門一丁目１７番１号 虎ノ門ヒルズ ビジネスタワー ●ご使用の前に「取扱説明書」をよくお読みのうえ正しくご使用ください。 TEL（: 03）3504-5768 E-mail :hhtgene.aj@hitachi-hightech.com www.hitachi-hightech.com/jp/ja/lm/ お問い合わせは̶̶ 3504-7211 本社 〒104-0041 東京都中央区新富二丁目15番5号 RBM築地ビル TEL:(0120)-513-522 www.hitachi-hightech.com/han/ ●このカタログに掲載した製品は、改善のため外観または仕様の一部を予告なく変更することがあります。 ●Copyright(C)　Hitachi High-Tech Corporation 2025 All rights reserved. HTB-281V 2025.6